新疆以前还真的是大海，且不仅新疆是大海，就连新疆南部的青藏高原原先也都是大海，这一点通过地区地质考察就能得到准确验证。不过，新疆的海洋环境距离现代非常遥远，至少可以追溯到4亿多年前的古生代，且新疆的戈壁滩也不是由原先的海洋环境而遗留的，相反海洋消失后的很长一段时间新疆都没有戈壁、沙漠，今天我们所看到的新疆地貌，是海洋消失后至少2亿年以上才逐渐形成的。
从当前新疆的地形地貌来看，其不但距离海洋非常遥远，且四周及中心部位都被高山包围，北面有阿尔泰山，中部有天山山脉，南部则是连绵青藏高原，这样的环境看起来与海洋没有一丁点关系，实则不然。4.4亿年前的古生代，新疆地区属于古特提斯海的一部分，那个时候地球的气候还相对比较炎热，七大洲还不是呈当前这种排列方式。
而到了中生代时期，冈瓦纳古陆开始解体，非洲板块和印度板块相继向北移动，古特提斯海开始慢慢收拢，我国新疆地区才逐渐从海洋环境转变为陆地。不过，这个转变过程至少持续了近2亿年，直到距今 约6500 万年前的始新世晚期，印度板块彻底与亚欧大陆板块相撞，形成了剧烈的地壳板块构造运动，青藏高原隆起，古特提斯海彻底消亡，整个新疆才彻底转变为陆地样态。
再后来发生的事情基本上我们就都清楚了，由于青藏高原阻挡了印度洋水汽北上，新疆地区降雨量变得非常稀少，再加上人类活动汲取新疆河流淡水越来越多，最终新疆盆地内的多个湖泊干涸为沙漠，比如著名的罗布泊。
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